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Un consortium international de scientifiques a analysé les gènes codants pour les protéines de près de 46 000 personnes, liant des altérations rares de l’ADN au diabète de type 2. Cette étude, l’une des plus importantes de ce type, comprend des données sur des personnes d’origine européenne, afro-américaine, hispanique, asiatique de l’Est et du Sud.

De rares variations de l’ADN seraient liées au diabète de type 2

Les chercheurs faisant partie de ce consortium – qui ont analysé environ 21 000 personnes atteintes de diabète de type 2 et 25 000 personnes en bonne santé – ont identifié quatre gènes contenant des variants rares qui affectent le risque de développer le diabète. Ces données suggèrent que des centaines de gènes supplémentaires seront probablement identifiés à l’avenir.
Ces gènes et les protéines qu’ils codent sont des cibles potentielles pour de nouveaux médicaments et pourraient guider les chercheurs dans la compréhension et le traitement de cette maladie.
« Ces résultats démontrent l’importance d’étudier de grands échantillons d’individus appartenant à un grand nombre d’ancêtres», a déclaré Michael Boehnke, auteur principal de l’étude, professeur de biostatistique et directeur du centre de génétique statistique de l’école de santé publique de l’Université du Michigan. « La plupart des grandes études démographiques portent sur des individus d’ascendance européenne, ce qui peut rendre difficile la généralisation des résultats à l’échelle mondiale. Plus la cohorte est diversifiée, plus la science devient informative. »
«Nous avons maintenant une image actualisée du rôle des variations rares de l’ADN pour le diabète», a déclaré Jason Flannick, premier auteur de l’étude. «Ces variantes rares constituent potentiellement une ressource beaucoup plus précieuse pour le développement de médicaments qu’on ne le pensait auparavant. Nous pouvons en effet détecter la preuve de leur association à de nombreux gènes qui pourraient être ciblés par de nouveaux médicaments ou étudiés pour comprendre les processus fondamentaux de la maladie. »

Ils ont séquencé «l’exome»

Dans le cadre de cette étude, les chercheurs ont séquencé ce que l’on appelle «l’exome», c’est-à-dire uniquement les régions du génome qui codent les protéines. Une autre approche pour trouver des variants associés à une maladie est appelée une étude d’association à l’échelle du génome, ou GWAS. Cette approche peut être très efficace pour rechercher des variantes de maladies communes dans l’ensemble du génome, mais peut passer à côté des variantes d’exomes moins courantes.
Et ceci est essentiel car, bien que les rares variantes de l’exome soient extrêmement difficiles à détecter, elles peuvent fournir des informations inestimables sur les gènes liés à cette maladie, ce qui peut à son tour suggérer de nouvelles cibles thérapeutiques.
Pour cette raison, les chercheurs souhaitent augmenter la taille des échantillons dans de études futures. Avec une cohorte de près de 50 000 personnes, il s’agit peut-être de la plus grande étude de séquençage d’exome du diabète de type 2, mais comme l’indiquent les auteurs dans leur article, il pourrait être nécessaire de disposer d’ échantillons compris entre 75 000 et 185 000 cas, même pour les variantes rares ayant le plus grand impact.

Il est essentiel de mieux comprendre les mécanismes biologiques de cette maladie

«Il est essentiel de se rappeler que, juste parce que nous examinons les variantes de l’ADN codant pour les protéines, nous ne devons pas limiter le nombre d’échantillons nécessaires pour détecter un effet significatif», explique Jose Florez. « Les effets de ces variations peuvent être puissants, mais étant donné leur rareté, nous devons encore augmenter la taille de l’échantillon afin de pouvoir obtenir des informations convaincantes. »
Selon les statistiques de l’Organisation mondiale de la santé, plus de 400 millions de personnes dans le monde sont atteintes de diabète. La grande majorité de ces cas sont de type 2. On estime que le diabète est la septième cause de décès dans le monde. Les chercheurs savent que le mode de vie et les facteurs environnementaux jouent un rôle important dans le diabète de type 2, mais il est essentiel de mieux comprendre les mécanismes biologiques à l’origine de cette maladie.
Cette étude a été publiée dans Nature.
Source : Broad Institute of MIT and Harvard
Crédit photo : Pixabay