L’IA détecte les virus causant des cancers

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Des signes de virus pouvant provoquer le cancer, tels que le virus du papillome humain (HPV) ou le virus d’Epstein-Barr (EBV), peuvent être détectés dans des échantillons de tissus avec des tests coûteux qui ne sont pas toujours très précis. Mais une nouvelle étude montre que l’intelligence artificielle peut détecter ces signes de manière fiable – et peut aussi aider les médecins.

L’IA détecte les virus qui causent des cancers

Certains cancers peuvent avoir des voies virales ou non, telles que le cancer de l’estomac ou le cancer de la tête et du cou. Dans ces cas, il est crucial de déterminer si un virus est impliqué afin de décider du meilleur traitement.

Jakob Nikolas Kather de l’hôpital universitaire RWTH d’Aachen en Allemagne et ses collègues ont formé un réseau de neurones à l’aide d’images de tissus tumoraux de l’Atlas du génome du cancer. Ces images de formation proviennent de 412 personnes atteintes d’un cancer de la tête et du cou, dont 12% ont été testées positives pour le HPV, et de 317 personnes atteintes d’un cancer de l’estomac, dont 8% ont été testées positives pour le EBV.

Le réseau de neurones a identifié avec précision la présence d’un virus dans des échantillons contenant du HPV 89% du temps et 80% du temps dans le cas d’échantillons contenant le virus EBV.

L’équipe a ensuite procédé à une ingénierie inverse en utilisant de faux échantillons de tissus prélevés sur le réseau de neurones, en utilisant un algorithme de vision par ordinateur appelé Deep Dream, qui leur permettait de voir quelles étaient les caractéristiques importantes observées par l’intelligence artificielle lorsqu’elle détectait les signes de la présence de virus.

Des motifs qui pourraient aider les médecins à mieux identifier les cancers

Ils ont montré les résultats à un panel d’experts en pathologie qui ont décrit les caractéristiques. Ils ont vu dans les images négatives pour le HPV un ensemble de petits nodules composés de couleurs vives et principalement chaudes», et dans les images positives pour le HPV «de grands nodules avec des bordures arrondies composées de couleurs foncées et principalement froides ponctuées de points rouges».

Les images négatives EBV présentaient «des noeuds mal définies mal ponctuées de points bleus et des nodules jaunes» et les images positives à EBV montraient «des nodules se chevauchant avec des motifs réticulés aux couleurs pastel». L’équipe derrière cette étude suggère que ces motifs pourraient aider les médecins à mieux identifier les signes de la présence de virus liés au cancer.

Cette recherche a été publiée dans bioRxiv.

Source : New Scientist
Crédit photo : Pixabay (montage)

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