patient-hospitalisation-change=le-microbiome
Une hospitalisation peut faire des ravages dans vos bactéries intestinales. Les personnes traitées pendant plusieurs jours dans un hôpital de soins intensifs ont vu leur estomac rapidement colonisé par des agents pathogènes nocifs, selon une étude.

Une longue hospitalisation peut perturber le microbiome

Des microbes intestinaux plus sains peuvent être éliminés – un changement qui peut avoir des effets négatifs à long terme après la sortie d’un patient. L’utilisation excessive d’antibiotiques à large spectre, l’alimentation des gens par un tube et l’utilisation d’un ventilateur pour les aider à respirer pourraient tous contribuer à cet effet, selon l’équipe qui a mené cette étude.
« C’est assez déconcertant « , déclare Mark Pallen, chercheur en génomique microbienne à l’Institut Quadram, au Royaume-Uni, qui a dirigé cette recherche. « J’ai été surpris. Je soupçonnais que quelque chose comme ça se passait, mais j’ai été très surpris par l’ampleur des changements. »
Pour évaluer l’impact des soins intensifs sur le microbiome intestinal, l’équipe a suivi 24 patients admis pour traumatisme, crise cardiaque, cancer et autres urgences au Queen Elizabeth Hospital de Birmingham, au Royaume-Uni, sur une période de dix mois.
Bon nombre des patients, âgés de 25 à 85 ans, étaient inconscients ou sous sédatifs. Après avoir obtenu la permission des membres de leur famille, les scientifiques ont prélevé des échantillons de selles de ces patients. À l’aide d’une technique appelée « shotgun metagenomics », ils ont extrait et séquencé l’ADN des échantillons pour identifier quels microbes étaient présents – et comment cela a changé au cours de leur traitement.
Les deux tiers des patients avaient une réduction marquée de la diversité microbienne comparativement à un autre séjour à l’hôpital. Les changements les plus importants ont été associés à l’utilisation intraveineuse de l’antibiotique méropénem.

Une diversité qui s’effondre

L’intestin abrite normalement un ensemble très riche et polyvalent de micro-organismes, explique M. Pallen. « Alors que chez ces patients, nous voyons toute cette diversité s’effondrer jusqu’à la domination du microbiote intestinal par un seul organisme se reproduisant en grand nombre. »
Le plus souvent, ils ont constaté que les intestins des patients étaient dominés par des quantités élevées d’Enterococcus faecium, un pathogène bactérien courant. C’est un problème parce que ce microbe peut s’étendre hors de l’intestin et endommager d’autres parties du corps, y compris les poumons. S’il atteint la circulation sanguine, il peut être mortel.
Ce qui est particulièrement inquiétant, selon M. Pallen, c’est que cette étude a mis en évidence la présence d’une seule souche d’E. faecium se propageant entre trois personnes. Il s’agit d’un petit nombre de patients dont on peut tirer des conclusions, mais ces résultats concordent avec ceux d’autres études, affirme Joost Wiersinga, du Centre médical universitaire d’Amsterdam, aux Pays-Bas.

Les médecins devraient faire plus attention

Bien que la priorité en soins intensifs soit toujours de sauver des vies, M. Wiersinga affirme que les médecins pourraient faire plus attention pour minimiser les perturbations des bactéries intestinales. « Si vous devez donner des antibiotiques, donnez-les. Mais pensez à quel antibiotique, pour combien de temps et si vous pouvez arrêter plus tôt il faut le faire. »
Cette recherche a été publiée dans Microbial Genomics.
Source : New Scientist
Crédit photo : Pixabay