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Des chercheurs du centre RIKEN pour les sciences médicales intégratives (IMS) au Japon et des collègues de l’université d’Osaka ont découvert des variations génétiques chez les humains liées à des habitudes alimentaires spécifiques. Cette étude d’association à l’échelle du génome a trouvé 9 gènes associés à la consommation d’aliments comme la viande, le fromage, le thé et le café. Parmi eux, trois étaient également liés à la présence de maladies particulières comme le cancer ou le diabète.

9 loci associés à des habitudes alimentaires spécifiques

Les études d’association à l’échelle du génome sont généralement menées lorsque les scientifiques veulent savoir si une maladie est liée à une variation génétique spécifique. Pour ce faire, ils regroupent des centaines de milliers de personnes selon qu’elles sont atteintes ou non de la maladie et comparent les génomes de différents groupes. Ils analysent l’ensemble du génome en examinant les variations de l’ADN appelées polymorphismes de nucléotides simples (SNP). S’ils trouvent un SNP qui est constamment associé au groupe de la maladie, ils peuvent dire que les personnes présentant cette variation génétique pourraient être à risque d’avoir cette maladie.
Mais plutôt que de s’intéresser aux maladies, l’équipe s’est penchée sur les habitudes alimentaires. Elle a voulu savoir s’il existe des variations génétiques spécifiques qui font que les gens sont « à risque » de consommer certains aliments d’une manière assidue. « Nous savons que ce que nous mangeons détermine ce que nous sommes, mais nous avons découvert que ce que nous sommes détermine également ce que nous mangeons », déclare Yukinori Okada, chercheur invité principal et professeur à l’université d’Osaka.

Des corrélations génétiques entre la consommation de fromage et de yaourt

En utilisant les données génétiques de plus de 160 000 Japonais qui avaient rempli un questionnaire sur la fréquence de la consommation d’aliments, ils ont trouvé 9 loci génétiques – des positions sur les chromosomes – qui étaient associés à la consommation de café, de thé, d’alcool, de yaourt, de fromage, de nattō, de tofu, de poisson, de légumes ou de viande. Les premières associations entre le régime alimentaire et le génome ont montré que les ingrédients avaient de l’importance. Par exemple, ils ont trouvé des corrélations génétiques positives entre la consommation de fromage et de yaourt.
Dans l’ensemble, cette étude a mis en évidence dix associations régime-génome qui n’avaient jamais été signalées auparavant, quatre concernant le café et trois l’alcool. Un SNP déjà connu pour être associé au café et à l’alcool s’est avéré être lié à presque tous les éléments alimentaires examinés. « Nous avons découvert que cette variation particulière d’un seul nucléotide d’ADN au niveau du gène ALDH2 était liée à une plus faible consommation d’alcool, de nattō, de tofu et de poisson, et en même temps, à une consommation plus importante de café, de thé vert, de lait et de yaourt », explique Okada.
Tout comme le génome comprend tout le matériel génétique d’un organisme, le phénome comprend tous les traits observables possibles, connus sous le nom de phénotypes. Afin de déterminer si certains des SNP associés à l’alimentation étaient également liés à des maladies, les chercheurs ont réalisé une étude d’association à l’échelle du phénome. Les résultats ont indiqué que six des SNP étaient liés à au moins un phénotype de maladie, y compris plusieurs types de cancer ainsi que le diabète de type 2.

Des résultats qui peuvent aider les personnes à risques

Comme pour les études d’association pangénomique pour les maladies, les résultats actuels peuvent être bénéfiques à la société à long terme. Comme l’explique Okada, « en estimant les différences individuelles dans les habitudes alimentaires à partir de la génétique, en particulier le « risque » d’être un buveur d’alcool, nous pouvons contribuer à créer une société plus saine ».
Cette recherche a été publiée dans Nature Human Behaviour.
Source : Riken Center
Crédit photo : Pixabay