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Une seule protéine dérivée d’une souche commune de bactéries présentes dans le sol offrira aux scientifiques un moyen plus précis d’éditer l’ARN. Cette protéine, appelée AcrVIA1, peut arrêter le processus d’édition CRISPR-Cas13, selon de nouvelles recherches de Cornell, de l’université Rockefeller et du Memorial Sloan Kettering Cancer Center.

La protéine AcrVIA1 est un interrupteur

« Nous élargissons notre boîte à outils scientifiques pour utiliser efficacement CRISPR sans provoquer d’effets secondaires », a déclaré le coauteur Martin Wiedmann. « Grâce à cette bactérie, nous avons la possibilité d’éteindre et d’allumer notre capacité à modifier l’ARN ».
L’outil CRISPR est un mécanisme qui peut agir comme des ciseaux microscopiques et modifier avec précision les gènes contenus dans l’ADN. Parmi la demi-douzaine de types de CRISPR utilisés aujourd’hui, CRISPR-Cas13 peut éditer l’ARN, qui jusqu’à présent n’avait pas de frein dans le processus d’édition.
Comme le SRAS-CoV-2, le coronavirus qui cause la maladie du COVID-19, est un virus à ARN, ce nouvel accessoire d’édition pourrait être utile aux chercheurs qui analysent les coronavirus, ont déclaré les scientifiques.
L’auteur principal Alex Meeske, chercheur postdoctoral dans le laboratoire de l’auteur principal Luciano Marraffini, professeur à l’université Rockefeller, avait soupçonné qu’une protéine (bactériophage) logée dans la Listeria pourrait être utile pour l’édition de l’ARN.
Au début de cette étude, M. Meeske a contacté M. Wiedmann, un expert en sécurité alimentaire, pour obtenir des échantillons bactériens de sa collection de pathogènes alimentaires. Le candidat au doctorat du laboratoire Wiedmann, Jingqiu Liao, a réduit les liste d’environ 1 500 candidats bactériens à 62 souches.

La Listeria seeligeri est inoffensive 

Le laboratoire Wiedmann a transféré ces échantillons à Rockefeller, où la stagiaire Alice Cassel a séquencé ces 62 souches et isolé 20 protéines candidates. Une souche s’est distinguée : la Listeria seeligeri, une bactérie inoffensive que l’on trouve partout dans le sol.
Les scientifiques de Rockefeller ont découvert que la protéine AcrVIA1 – dérivée de L. seeligeri – a instantanément interrompu le processus d’édition CRISPR. « L’AcrVIA1 peut être très utile pour contrôler l’utilisation de Cas13. Tout ce que le Cas13 édite, cette protéine anti-CRISPR peut l’arrêter », a déclaré M. Meeske. C’est un « interrupteur » que vous pouvez utiliser pendant le processus d’édition avec CRISPR, et c’est devenu un outil supplémentaire que nous avons à notre disposition ».
Wiedmann a expliqué que les scientifiques peuvent maintenant travailler sur les problèmes d’ARN avec des moyens plus élaborés. « Cet outil nous donne plus de précision », a-t-il dit.
Cette recherche a été publiée dans Science
Source : Cornell University
Crédit photo : Free Images

La protéine de la Listeria fournit un "interrupteur" CRISPR martinbiothechnologie
Une seule protéine dérivée d'une souche commune de bactéries présentes dans le sol offrira aux scientifiques un moyen plus précis d'éditer l'ARN. Cette protéine, appelée AcrVIA1, peut arrêter le processus d'édition CRISPR-Cas13, selon de nouvelles recherches de Cornell, de l'université Rockefeller et du Memorial Sloan Kettering Cancer Center. La protéine...