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Lors d’un test d’efficacité antivirale contre le virus à l’origine de COVID-19, un extrait d’algues comestibles a largement dépassé le remdesivir, l’antiviral standard actuellement utilisé pour combattre cette maladie.

Un leurre extrait d’une algue

L’héparine, un anticoagulant courant, et une variante de l’héparine dépourvue de ses propriétés anticoagulantes, ont obtenu des résultats équivalents à ceux du remdésivir dans l’inhibition de l’infection par le SRAS-CoV-2 dans les cellules de mammifères.
Cette recherche est le dernier exemple d’une stratégie de leurre que les chercheurs du Centre de biotechnologie et d’études interdisciplinaires (CBIS) de l’Institut polytechnique de Rensselear mettent au point contre des virus comme le nouveau coronavirus qui a engendré la crise sanitaire mondiale actuelle.
La protéine de pointe à la surface du SRAS-CoV-2 se fixe sur le récepteur ACE2, une molécule à la surface des cellules humaines. Une fois fixé, le virus insère son propre matériel génétique dans la cellule, détournant la machinerie cellulaire pour produire des répliques de virus. Mais le virus pourrait tout aussi bien être persuadé de se fixer sur une molécule leurre qui offre un ajustement similaire. Le virus neutralisé serait piégé et finirait par se dégrader naturellement.

Un leurre efficace

Les chercheurs ont testé l’activité antivirale de trois variantes d’héparine (héparine, héparine trisulfatée et héparine de faible poids moléculaire non anticoagulante) et de deux fucoidans (RPI-27 et RPI-28) extraits d’algues marines. Ces cinq composés sont tous de longues chaînes de molécules de sucre connues sous le nom de polysaccharides sulfatés, une conformation structurelle que les résultats d’une étude de liaison publiée au début du mois dans Antiviral Research suggéraient comme un leurre efficace.
Les chercheurs ont réalisé une étude de la relation dose-effet connue sous le nom de EC50 – abréviation de la concentration efficace du composé qui inhibe 50% de l’infectivité virale – avec chacun des cinq composés sur des cellules de mammifères. Pour les résultats d’une EC50, qui sont donnés en concentration molaire, une valeur plus faible indique un composé plus puissant.

Aucune toxicité

Le RPI-27 a donné une valeur de CE50 d’environ 83 nanomolaires, tandis qu’un test in vitro similaire, publié précédemment et indépendant, du remdesivir sur les mêmes cellules de mammifères a donné une CE50 de 770 nanomolaires. L’héparine a donné une CE50 de 2,1 micromolaire, soit environ un tiers aussi active que le remdesivir, et un analogue non anticoagulant de l’héparine a donné une CE50 de 5,0 micromolaire, soit environ un cinquième aussi active que le remdesivir. Un autre test n’a révélé aucune toxicité cellulaire dans aucun des composés, même à des concentrations élevées.
« Ce qui nous intéresse, c’est une nouvelle façon d’aborder l’infection », a déclaré Robert Linhardt qui collabore avec Dordick pour développer cette stratégie de leurre. « L’idée actuelle est que l’infection par le COVID-19 commence dans le nez, et que l’une ou l’autre de ces substances pourrait être à la base d’un spray nasal. Si vous pouviez simplement traiter l’infection à un stade précoce, ou même la traiter avant qu’elle ne se déclare, vous auriez un moyen de la bloquer avant qu’elle ne pénètre dans l’organisme ».
« Une chose qui est devenue claire avec cette étude, c’est que plus la molécule est grosse, mieux elle s’adapte. Les composés les plus efficaces sont les grands polysaccharides sulfatés qui offrent un plus grand nombre de sites sur les molécules pour piéger le virus », a déclaré M. Dordick

Des polysaccharides sulfatés similaires

La modélisation moléculaire basée sur l’étude de liaison a révélé des sites sur la protéine du pique où l’héparine était capable d’interagir, ce qui ouvre des perspectives pour des polysaccharides sulfatés similaires.
Cette recherche a été publiée dans Cell discovery.
Source : Rensselaer Polytechnic Institute
Crédit photo : Pixabay

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