ARN-viral-du-SARS-CoV-2-une-nouvelle-cible-potentielle

Lorsque le SARS-CoV-2 infecte une cellule, il y introduit son ARN et le reprogramme de telle sorte que la cellule produit d’abord des protéines virales, puis des particules virales entières.

L’ARN viral du SARS-CoV-2

Dans leur recherche de substances actives contre le SARS-CoV-2, les chercheurs se sont jusqu’à présent surtout concentrés sur les protéines virales et sur leur blocage, car cela promet d’empêcher, ou du moins de ralentir, la réplication. Mais s’attaquer au génome viral, une longue molécule d’ARN, pourrait également arrêter ou ralentir la réplication virale.

Les scientifiques du consortium COVID-19-NMR, coordonné par le professeur Harald Schwalbe de l’Institut de chimie organique et de biologie chimique de l’université Goethe, ont maintenant franchi une première étape importante dans le développement de cette nouvelle classe de médicaments contre le SARS-CoV-2.

Ils ont identifié 15 courts segments du génome du SARS-CoV-2 qui sont très similaires dans divers coronavirus et sont connus pour remplir des fonctions de régulation essentielles. Au cours de l’année 2020 également, ces segments ont été très rarement affectés par des mutations.

Les chercheurs ont laissé une bibliothèque de 768 petites molécules chimiquement simples interagir avec les 15 segments d’ARN et ont analysé le résultat au moyen de la spectroscopie NMR. En spectroscopie NMR, les molécules sont d’abord marquées avec des types d’atomes spéciaux (isotopes stables), puis exposées à un champ magnétique puissant.

Les noyaux atomiques sont excités au moyen d’une courte impulsion de radiofréquence et émettent un spectre de fréquences, à l’aide duquel il est possible de déterminer la structure des ARN et des protéines et comment et où les petites molécules se lient.

69 petites molécules intéressantes

L’équipe de recherche dirigée par le professeur Schwalbe a ainsi pu identifier 69 petites molécules qui se sont liées à 13 des 15 segments d’ARN. Selon le professeur Harald Schwalbe, « trois de ces molécules se lient même spécifiquement à un seul segment d’ARN.

Nous avons ainsi pu montrer que l’ARN du SARS-CoV-2 convient parfaitement comme structure cible potentielle pour les médicaments. Compte tenu du grand nombre de mutations du SARS-CoV-2, ces segments d’ARN conservateurs, comme ceux que nous avons identifiés, sont particulièrement intéressants pour le développement d’inhibiteurs potentiels.

Et comme l’ARN viral représente jusqu’à deux tiers de l’ensemble de l’ARN d’une cellule infectée, nous devrions être en mesure de perturber la réplication virale à une échelle considérable en utilisant des molécules appropriées. »

Des essais de suivi

Dans ce contexte, poursuit Schwalbe, les chercheurs ont maintenant déjà commencé des essais de suivi avec des substances facilement disponibles qui sont chimiquement similaires aux partenaires de liaison de la bibliothèque de substances.

Cette recherche a été publiée dans Angewandte Chemie International Edition.

Source : Goethe University Frankfurt am Main
Crédit photo : Pexels